Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn11Q6J756 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms