Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmcc1Q69ZZ6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmcc1Q69ZZ6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms