Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sptbn2Q68FG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sptbn2Q68FG2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms