Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp9bQ66X22 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp9bQ66X22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms