Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm4sf1Q64302 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm4sf1Q64302 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms