Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScxQ64124 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ScxQ64124 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ScxQ64124 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ScxQ64124 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ScxQ64124 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ScxQ64124 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ScxQ64124 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ScxQ64124 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms