Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup62Q63850 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms