Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vat1Q62465 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms