Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx1Q62443 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms