Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpd52Q62393 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpd52Q62393 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpd52Q62393 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms