Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrhQ62361 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TrhQ62361 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrhQ62361 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms