Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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Trim28Q62318 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim28Q62318 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim28Q62318 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1002.4 ms