Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn9aQ62205 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn9aQ62205 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn9aQ62205 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms