Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Prm3Q62100 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prm3Q62100 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prm3Q62100 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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