Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne1Q61457 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne1Q61457 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms