Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnna2Q61301 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms