Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9a1Q61165 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms