Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Astn1Q61137 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Astn1Q61137 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Astn1Q61137 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Astn1Q61137 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Astn1Q61137 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Astn1Q61137 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Astn1Q61137 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms