Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf3Q60980 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms