Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp7Q60973 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms