Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac1Q60932 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vdac1Q60932 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms