Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a1Q60737 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a1Q60737 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms