Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm1Q60636 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prdm1Q60636 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm1Q60636 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms