Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf123Q5XPI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf123Q5XPI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms