Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp20Q5XG71 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp20Q5XG71 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms