Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc5a6Q5U4D8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc5a6Q5U4D8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms