Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gprasp1Q5U4C1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gprasp1Q5U4C1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gprasp1Q5U4C1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms