Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctc1Q5SUQ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctc1Q5SUQ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctc1Q5SUQ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms