Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Utp18Q5SSI6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp18Q5SSI6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms