Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sun3Q5SS91 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms