Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

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Length 778 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brsk1Q5RJI5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brsk1Q5RJI5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brsk1Q5RJI5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brsk1Q5RJI5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brsk1Q5RJI5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brsk1Q5RJI5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Brsk1Q5RJI5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Brsk1Q5RJI5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brsk1Q5RJI5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms