Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlha9Q5RJB0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms