Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm6bQ5NCY0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm6bQ5NCY0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm6bQ5NCY0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms