Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp28Q5I043 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Usp28Q5I043 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Usp28Q5I043 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp28Q5I043 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Usp28Q5I043 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Usp28Q5I043 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Usp28Q5I043 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Usp28Q5I043 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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