Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm3Q5F4S9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms