Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srrm1Q52KI8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srrm1Q52KI8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srrm1Q52KI8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms