Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms