Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syne3Q4FZC9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms