Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1orf109Q499E6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf109Q499E6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms