Protein–RNA interactions for Protein: Q497N7

Uncharacterized protein C6orf201 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q497N7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q497N7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q497N7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q497N7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q497N7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q497N7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q497N7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q497N7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q497N7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q497N7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms