Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec4Q497M3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec4Q497M3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms