Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx25Q3ZT31 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx25Q3ZT31 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx25Q3ZT31 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms