Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3E1

Ubash3a, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3aQ3V3E1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubash3aQ3V3E1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3aQ3V3E1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubash3aQ3V3E1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms