Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Samd5Q3V1H9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd5Q3V1H9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms