Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700057G04RikQ3V0U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms