Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl5Q3UTQ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl5Q3UTQ8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms