Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Obox3Q3UT54 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms