Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Znf48Q3US17 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf48Q3US17 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Znf48Q3US17 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf48Q3US17 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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