Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc51Q3URS9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc51Q3URS9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc51Q3URS9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms