Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbsponQ3UPR9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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